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RESUMEN: Debido a que los langostinos silvestres son potenciales fuentes de enfermedades infecciosas, la vigilancia sanitaria en estas poblaciones es importante para prevenir el riesgo de brotes en los centros de cultivo. En este trabajo, se analizaron langostinos silvestres de las especies Litopenaeus vannamei y Litopenaeus stylirostris provenientes de ambientes colindantes a los centros de cultivo en el norte del Perú, con el objetivo de caracterizar genéticamente al virus del síndrome de las manchas blancas (WSSV) y a bacterias Vibrio relacionadas con la enfermedad de la necrosis hepatopancreática aguda (AHPND), que son dos de los principales patógenos que causan enfermedades a los langostinos en cultivo. En una cepa del WSSV se analizó los marcos de lectura abierta (ORF) 75, 94, 125, 14/15, y 23/24, logrando detectar que los ORF 75, 94 y 125 están formados respectivamente por 6, 3 y 2 unidades repetitivas de tipo VNTR, mientras que los ORF 14/15 y 23/24 presentaron deleciones de ADN de 5138 pb y 11110 pb, respectivamente. En cuatro cepas de Vibrio relacionadas con la AHPND se secuenciaron 14 genes, lográndose identificar a tres cepas como Vibrio parahaemolyticus y una como Vibrio campbellii, mediante el secuenciamiento de los genes 16S ARN, rpoB, rpoA, recA y pyrH; mientras que, con los genes pirA, pirB, toxR, luxR, tdh, trh, tetB y dos genes para proteasas, se logró caracterizar la variabilidad de sus factores de patogenicidad en las cuatro cepas de Vibrio analizadas. La detección de variantes genéticas en los patógenos evaluados proporciona una base sólida para estudios epidemiológicos y para el desarrollo de estrategias de manejo que mitiguen su impacto en la acuicultura de langostinos.
ABSTRACT: Since wild shrimp can serve as reservoirs for infectious agents, ongoing health surveillance of these populations is essen-tial to prevent disease outbreaks in aquaculture systems. This study analyzed wild specimens of Litopenaeus vannamei and Litopenaeus stylirostris collected from coastal environments adjacent to shrimp farms in northern Peru, with the objective of genetically characterizing the white spot syndrome virus (WSSV) and Vibrio species associated with acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND)—two of the most critical pathogens affecting cultured shrimp worldwide. In one WSSV strain, five open reading frames (ORFs 75, 94, 125, 14/15, and 23/24) were examined. ORFs 75, 94, and 125 consisted of six, three, and two variable number tandem repeat (VNTR) units, respectively, while ORFs 14/15 and 23/24 exhibited DNA deletions of 5,138 bp and 11,110 bp. For Vibrio isolates associated with AHPND, fourteen genes were sequenced. Phylogenetic analy-sis identified three strains as Vibrio parahaemolyticus and one as Vibrio campbellii, based on the sequences of 16S rRNA, rpoB, rpoA, recA, and pyrH. In addition, the presence and variability of virulence factors were characterized through the analysis of pirA, pirB, toxR, luxR, tdh, trh, tetB, and two protease genes, revealing distinct pathogenicity profiles among the four isolates. The identification of genetic variants in both WSSV and Vibrio strains provides valuable insight into their molecular diver-sity and lays the groundwork for epidemiological studies and the development of biosecurity and management strategies aimed at reducing their impact on shrimp aquaculture
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